Protein–RNA interactions for Protein: O88413

Tulp3, Tubby-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp3O88413 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp3O88413 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tulp3O88413 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tulp3O88413 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp3O88413 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp3O88413 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp3O88413 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp3O88413 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp3O88413 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp3O88413 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp3O88413 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp3O88413 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp3O88413 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp3O88413 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp3O88413 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp3O88413 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp3O88413 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp3O88413 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp3O88413 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp3O88413 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp3O88413 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp3O88413 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp3O88413 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp3O88413 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp3O88413 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp3O88413 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp3O88413 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tulp3O88413 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tulp3O88413 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.2 ms