Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxq1O70220 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxq1O70220 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxq1O70220 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxq1O70220 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxq1O70220 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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