Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna4O70174 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna4O70174 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna4O70174 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna4O70174 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna4O70174 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna4O70174 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna4O70174 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna4O70174 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna4O70174 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna4O70174 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna4O70174 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna4O70174 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms