Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cer1O55233 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cer1O55233 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cer1O55233 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cer1O55233 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cer1O55233 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cer1O55233 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cer1O55233 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cer1O55233 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cer1O55233 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cer1O55233 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cer1O55233 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cer1O55233 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cer1O55233 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cer1O55233 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cer1O55233 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cer1O55233 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cer1O55233 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cer1O55233 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cer1O55233 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cer1O55233 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cer1O55233 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cer1O55233 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cer1O55233 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cer1O55233 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cer1O55233 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cer1O55233 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cer1O55233 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cer1O55233 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cer1O55233 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cer1O55233 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cer1O55233 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cer1O55233 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cer1O55233 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cer1O55233 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms