Protein–RNA interactions for Protein: O55022

Pgrmc1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgrmc1O55022 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pgrmc1O55022 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pgrmc1O55022 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pgrmc1O55022 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pgrmc1O55022 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms