Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trappc3O55013 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc3O55013 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trappc3O55013 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trappc3O55013 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc3O55013 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms