Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itgb3O54890 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itgb3O54890 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb3O54890 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb3O54890 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms