Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EomesO54839 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EomesO54839 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EomesO54839 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EomesO54839 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EomesO54839 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EomesO54839 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EomesO54839 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EomesO54839 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EomesO54839 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EomesO54839 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EomesO54839 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EomesO54839 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EomesO54839 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EomesO54839 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EomesO54839 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EomesO54839 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EomesO54839 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EomesO54839 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EomesO54839 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EomesO54839 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EomesO54839 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EomesO54839 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EomesO54839 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EomesO54839 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EomesO54839 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EomesO54839 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EomesO54839 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EomesO54839 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EomesO54839 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EomesO54839 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EomesO54839 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EomesO54839 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EomesO54839 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EomesO54839 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EomesO54839 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EomesO54839 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EomesO54839 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EomesO54839 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EomesO54839 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EomesO54839 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EomesO54839 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EomesO54839 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EomesO54839 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EomesO54839 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EomesO54839 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EomesO54839 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EomesO54839 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EomesO54839 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EomesO54839 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EomesO54839 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EomesO54839 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EomesO54839 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EomesO54839 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EomesO54839 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EomesO54839 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EomesO54839 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EomesO54839 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EomesO54839 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EomesO54839 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EomesO54839 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EomesO54839 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EomesO54839 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EomesO54839 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EomesO54839 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EomesO54839 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EomesO54839 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EomesO54839 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EomesO54839 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EomesO54839 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EomesO54839 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EomesO54839 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EomesO54839 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EomesO54839 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EomesO54839 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EomesO54839 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EomesO54839 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EomesO54839 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EomesO54839 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EomesO54839 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EomesO54839 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EomesO54839 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EomesO54839 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EomesO54839 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EomesO54839 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EomesO54839 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EomesO54839 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EomesO54839 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EomesO54839 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EomesO54839 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EomesO54839 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EomesO54839 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EomesO54839 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EomesO54839 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EomesO54839 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EomesO54839 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EomesO54839 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EomesO54839 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EomesO54839 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EomesO54839 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms