Protein–RNA interactions for Protein: O54824

Il16, Pro-interleukin-16, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il16O54824 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34,47■■■■□ 3,11
Il16O54824 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Il16O54824 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Il16O54824 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Il16O54824 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Il16O54824 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Il16O54824 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Il16O54824 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,1
Il16O54824 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Il16O54824 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Il16O54824 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Il16O54824 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Il16O54824 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Il16O54824 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Il16O54824 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Il16O54824 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Il16O54824 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Il16O54824 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34,38■■■■□ 3,09
Il16O54824 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Il16O54824 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Il16O54824 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Il16O54824 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Il16O54824 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Il16O54824 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34,36■■■■□ 3,09
Il16O54824 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Il16O54824 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Il16O54824 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Il16O54824 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Il16O54824 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Il16O54824 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Il16O54824 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Il16O54824 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Il16O54824 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Il16O54824 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Il16O54824 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Il16O54824 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34,32■■■■□ 3,09
Il16O54824 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Il16O54824 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Il16O54824 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34,32■■■■□ 3,09
Il16O54824 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Il16O54824 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Il16O54824 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Il16O54824 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Il16O54824 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Il16O54824 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Il16O54824 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Il16O54824 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34,28■■■■□ 3,08
Il16O54824 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Il16O54824 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Il16O54824 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Il16O54824 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Il16O54824 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Il16O54824 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Il16O54824 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Il16O54824 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Il16O54824 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Il16O54824 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Il16O54824 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34,24■■■■□ 3,07
Il16O54824 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Il16O54824 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Il16O54824 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Il16O54824 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Il16O54824 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Il16O54824 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Il16O54824 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Il16O54824 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Il16O54824 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Il16O54824 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Il16O54824 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Il16O54824 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Il16O54824 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Il16O54824 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Il16O54824 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Il16O54824 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Il16O54824 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Il16O54824 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Il16O54824 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Il16O54824 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Il16O54824 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Il16O54824 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Il16O54824 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Il16O54824 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Il16O54824 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Il16O54824 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Il16O54824 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Il16O54824 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Il16O54824 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Il16O54824 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Il16O54824 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Il16O54824 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Il16O54824 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Il16O54824 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Il16O54824 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Il16O54824 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Il16O54824 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34,07■■■■□ 3,04
Il16O54824 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Il16O54824 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Il16O54824 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Il16O54824 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Il16O54824 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,8 ms