Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EdaO54693 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EdaO54693 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EdaO54693 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EdaO54693 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EdaO54693 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EdaO54693 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EdaO54693 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EdaO54693 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EdaO54693 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EdaO54693 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EdaO54693 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EdaO54693 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EdaO54693 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EdaO54693 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EdaO54693 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EdaO54693 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EdaO54693 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EdaO54693 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EdaO54693 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EdaO54693 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EdaO54693 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EdaO54693 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EdaO54693 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EdaO54693 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EdaO54693 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EdaO54693 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EdaO54693 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EdaO54693 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EdaO54693 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EdaO54693 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EdaO54693 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EdaO54693 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EdaO54693 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EdaO54693 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EdaO54693 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EdaO54693 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EdaO54693 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EdaO54693 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EdaO54693 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EdaO54693 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EdaO54693 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EdaO54693 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EdaO54693 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EdaO54693 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EdaO54693 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EdaO54693 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EdaO54693 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EdaO54693 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EdaO54693 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EdaO54693 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EdaO54693 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EdaO54693 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EdaO54693 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EdaO54693 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EdaO54693 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EdaO54693 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EdaO54693 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EdaO54693 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EdaO54693 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EdaO54693 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EdaO54693 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EdaO54693 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EdaO54693 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EdaO54693 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EdaO54693 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EdaO54693 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EdaO54693 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EdaO54693 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EdaO54693 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EdaO54693 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EdaO54693 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EdaO54693 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EdaO54693 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EdaO54693 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EdaO54693 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EdaO54693 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EdaO54693 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EdaO54693 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EdaO54693 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EdaO54693 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EdaO54693 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EdaO54693 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EdaO54693 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EdaO54693 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EdaO54693 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EdaO54693 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EdaO54693 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EdaO54693 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EdaO54693 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EdaO54693 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EdaO54693 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EdaO54693 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EdaO54693 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EdaO54693 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EdaO54693 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EdaO54693 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EdaO54693 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EdaO54693 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EdaO54693 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms