Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cops5O35864 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cops5O35864 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops5O35864 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops5O35864 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops5O35864 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops5O35864 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops5O35864 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cops5O35864 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cops5O35864 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cops5O35864 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cops5O35864 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cops5O35864 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cops5O35864 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cops5O35864 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cops5O35864 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cops5O35864 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cops5O35864 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cops5O35864 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cops5O35864 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cops5O35864 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cops5O35864 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cops5O35864 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cops5O35864 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cops5O35864 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cops5O35864 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cops5O35864 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cops5O35864 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cops5O35864 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops5O35864 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops5O35864 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cops5O35864 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cops5O35864 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cops5O35864 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops5O35864 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops5O35864 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cops5O35864 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cops5O35864 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms