Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NudcO35685 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NudcO35685 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NudcO35685 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NudcO35685 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NudcO35685 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NudcO35685 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NudcO35685 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NudcO35685 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NudcO35685 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NudcO35685 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NudcO35685 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NudcO35685 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NudcO35685 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NudcO35685 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NudcO35685 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NudcO35685 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NudcO35685 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NudcO35685 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NudcO35685 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NudcO35685 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NudcO35685 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NudcO35685 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NudcO35685 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NudcO35685 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NudcO35685 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NudcO35685 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NudcO35685 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NudcO35685 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NudcO35685 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NudcO35685 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NudcO35685 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NudcO35685 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NudcO35685 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NudcO35685 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NudcO35685 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NudcO35685 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NudcO35685 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NudcO35685 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NudcO35685 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NudcO35685 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NudcO35685 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NudcO35685 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NudcO35685 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NudcO35685 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NudcO35685 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NudcO35685 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NudcO35685 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NudcO35685 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NudcO35685 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NudcO35685 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NudcO35685 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NudcO35685 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NudcO35685 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NudcO35685 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NudcO35685 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NudcO35685 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NudcO35685 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NudcO35685 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NudcO35685 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NudcO35685 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NudcO35685 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NudcO35685 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NudcO35685 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NudcO35685 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NudcO35685 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NudcO35685 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NudcO35685 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NudcO35685 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NudcO35685 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NudcO35685 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NudcO35685 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NudcO35685 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NudcO35685 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NudcO35685 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NudcO35685 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NudcO35685 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NudcO35685 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NudcO35685 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NudcO35685 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NudcO35685 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NudcO35685 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NudcO35685 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NudcO35685 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NudcO35685 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NudcO35685 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NudcO35685 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NudcO35685 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NudcO35685 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NudcO35685 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NudcO35685 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NudcO35685 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NudcO35685 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NudcO35685 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NudcO35685 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NudcO35685 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NudcO35685 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NudcO35685 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NudcO35685 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NudcO35685 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms