Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stag2O35638 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stag2O35638 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stag2O35638 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stag2O35638 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stag2O35638 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stag2O35638 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Stag2O35638 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stag2O35638 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stag2O35638 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stag2O35638 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stag2O35638 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stag2O35638 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag2O35638 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stag2O35638 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stag2O35638 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stag2O35638 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stag2O35638 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stag2O35638 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Stag2O35638 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stag2O35638 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Stag2O35638 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stag2O35638 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stag2O35638 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stag2O35638 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stag2O35638 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stag2O35638 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stag2O35638 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Stag2O35638 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stag2O35638 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stag2O35638 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms