Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1O35604 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npc1O35604 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npc1O35604 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npc1O35604 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npc1O35604 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Npc1O35604 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npc1O35604 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Npc1O35604 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npc1O35604 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Npc1O35604 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Npc1O35604 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npc1O35604 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npc1O35604 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npc1O35604 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npc1O35604 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Npc1O35604 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npc1O35604 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npc1O35604 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms