Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnih1O35372 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnih1O35372 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnih1O35372 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnih1O35372 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.2 ms