Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dgcr6O35347 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dgcr6O35347 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dgcr6O35347 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dgcr6O35347 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dgcr6O35347 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dgcr6O35347 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dgcr6O35347 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dgcr6O35347 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dgcr6O35347 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dgcr6O35347 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dgcr6O35347 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms