Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kpna4O35343 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kpna4O35343 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kpna4O35343 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kpna4O35343 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kpna4O35343 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms