Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nedd9O35177 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nedd9O35177 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nedd9O35177 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nedd9O35177 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nedd9O35177 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.6 ms