Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Polr1aO35134 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Polr1aO35134 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Polr1aO35134 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Polr1aO35134 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Polr1aO35134 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Polr1aO35134 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Polr1aO35134 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Polr1aO35134 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Polr1aO35134 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Polr1aO35134 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Polr1aO35134 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Polr1aO35134 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Polr1aO35134 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Polr1aO35134 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Polr1aO35134 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Polr1aO35134 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Polr1aO35134 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Polr1aO35134 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Polr1aO35134 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Polr1aO35134 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Polr1aO35134 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Polr1aO35134 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Polr1aO35134 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Polr1aO35134 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Polr1aO35134 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Polr1aO35134 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Polr1aO35134 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Polr1aO35134 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Polr1aO35134 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Polr1aO35134 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Polr1aO35134 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Polr1aO35134 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Polr1aO35134 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Polr1aO35134 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Polr1aO35134 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Polr1aO35134 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Polr1aO35134 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Polr1aO35134 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Polr1aO35134 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Polr1aO35134 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Polr1aO35134 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Polr1aO35134 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Polr1aO35134 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Polr1aO35134 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Polr1aO35134 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Polr1aO35134 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Polr1aO35134 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Polr1aO35134 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Polr1aO35134 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Polr1aO35134 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Polr1aO35134 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Polr1aO35134 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Polr1aO35134 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Polr1aO35134 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Polr1aO35134 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Polr1aO35134 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Polr1aO35134 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Polr1aO35134 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms