Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc23O35125 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrrc23O35125 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc23O35125 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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