Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn4O35054 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn4O35054 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cldn4O35054 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cldn4O35054 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn4O35054 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn4O35054 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn4O35054 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn4O35054 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn4O35054 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn4O35054 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn4O35054 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn4O35054 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn4O35054 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn4O35054 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn4O35054 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn4O35054 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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