Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckarO08786 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckarO08786 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckarO08786 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckarO08786 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckarO08786 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckarO08786 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CckarO08786 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckarO08786 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckarO08786 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckarO08786 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckarO08786 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckarO08786 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckarO08786 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CckarO08786 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CckarO08786 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckarO08786 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckarO08786 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckarO08786 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckarO08786 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckarO08786 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckarO08786 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckarO08786 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckarO08786 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckarO08786 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckarO08786 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckarO08786 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckarO08786 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckarO08786 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckarO08786 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckarO08786 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CckarO08786 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CckarO08786 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CckarO08786 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CckarO08786 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CckarO08786 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CckarO08786 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CckarO08786 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CckarO08786 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CckarO08786 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CckarO08786 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CckarO08786 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CckarO08786 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CckarO08786 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CckarO08786 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CckarO08786 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CckarO08786 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CckarO08786 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CckarO08786 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CckarO08786 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CckarO08786 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CckarO08786 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CckarO08786 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CckarO08786 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CckarO08786 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CckarO08786 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CckarO08786 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CckarO08786 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CckarO08786 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CckarO08786 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CckarO08786 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CckarO08786 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CckarO08786 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CckarO08786 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CckarO08786 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CckarO08786 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CckarO08786 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CckarO08786 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CckarO08786 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CckarO08786 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CckarO08786 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CckarO08786 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CckarO08786 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckarO08786 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckarO08786 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckarO08786 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckarO08786 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckarO08786 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CckarO08786 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CckarO08786 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CckarO08786 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CckarO08786 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CckarO08786 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CckarO08786 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CckarO08786 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CckarO08786 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CckarO08786 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CckarO08786 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CckarO08786 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CckarO08786 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CckarO08786 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckarO08786 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckarO08786 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckarO08786 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckarO08786 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CckarO08786 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CckarO08786 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CckarO08786 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CckarO08786 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CckarO08786 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms