Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltaO08585 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltaO08585 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltaO08585 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltaO08585 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltaO08585 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CltaO08585 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CltaO08585 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltaO08585 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltaO08585 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CltaO08585 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CltaO08585 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CltaO08585 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CltaO08585 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CltaO08585 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CltaO08585 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CltaO08585 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CltaO08585 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CltaO08585 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CltaO08585 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CltaO08585 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CltaO08585 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CltaO08585 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CltaO08585 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CltaO08585 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CltaO08585 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CltaO08585 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CltaO08585 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CltaO08585 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CltaO08585 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CltaO08585 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CltaO08585 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CltaO08585 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CltaO08585 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CltaO08585 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CltaO08585 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CltaO08585 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CltaO08585 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CltaO08585 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CltaO08585 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CltaO08585 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CltaO08585 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CltaO08585 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CltaO08585 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CltaO08585 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CltaO08585 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CltaO08585 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CltaO08585 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CltaO08585 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CltaO08585 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CltaO08585 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CltaO08585 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CltaO08585 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CltaO08585 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CltaO08585 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CltaO08585 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CltaO08585 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CltaO08585 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CltaO08585 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CltaO08585 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CltaO08585 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CltaO08585 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CltaO08585 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CltaO08585 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CltaO08585 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CltaO08585 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CltaO08585 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CltaO08585 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CltaO08585 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CltaO08585 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CltaO08585 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CltaO08585 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CltaO08585 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CltaO08585 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CltaO08585 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CltaO08585 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CltaO08585 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CltaO08585 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CltaO08585 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CltaO08585 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CltaO08585 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CltaO08585 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CltaO08585 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CltaO08585 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CltaO08585 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CltaO08585 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CltaO08585 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CltaO08585 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CltaO08585 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CltaO08585 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CltaO08585 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CltaO08585 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CltaO08585 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CltaO08585 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CltaO08585 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CltaO08585 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CltaO08585 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CltaO08585 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CltaO08585 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CltaO08585 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms