Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp35M0QWN7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp35M0QWN7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp35M0QWN7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp35M0QWN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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