Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3239L7N2D9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3239L7N2D9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3239L7N2D9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3239L7N2D9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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