Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3424L7N298 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3424L7N298 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3424L7N298 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm3424L7N298 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3424L7N298 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms