Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gm3402K7N5P2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3402K7N5P2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3402K7N5P2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3402K7N5P2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm3402K7N5P2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms