Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Vwa3bJ9JI28 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vwa3bJ9JI28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vwa3bJ9JI28 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vwa3bJ9JI28 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vwa3bJ9JI28 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vwa3bJ9JI28 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms