Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms