Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc191J3QQ27 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc191J3QQ27 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc191J3QQ27 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc191J3QQ27 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms