Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm379J3QQ19 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm379J3QQ19 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm379J3QQ19 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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