Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21887J3QQ04 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21887J3QQ04 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Gm21887J3QQ04 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm21887J3QQ04 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21887J3QQ04 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm21887J3QQ04 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21887J3QQ04 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21887J3QQ04 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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