Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm19965J3QNY8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm19965J3QNY8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm19965J3QNY8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm19965J3QNY8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm19965J3QNY8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm19965J3QNY8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm19965J3QNY8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm19965J3QNY8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm19965J3QNY8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm19965J3QNY8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm19965J3QNY8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm19965J3QNY8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm19965J3QNY8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm19965J3QNY8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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