Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43,25■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC43,24■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,24■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC43,24■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,22■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,22■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC43,22■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC43,22■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC43,22■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC43,21■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,21■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,2■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC43,2■■■■■ 4,51
Ccdc180J3QNE4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC43,19■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,19■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43,19■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,18■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,18■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC43,17■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC43,17■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC43,17■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC43,16■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC43,15■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC43,14■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,14■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC43,14■■■■■ 4,5
Ccdc180J3QNE4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,13■■■■■ 4,49
Ccdc180J3QNE4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43,12■■■■■ 4,49
Ccdc180J3QNE4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
Ccdc180J3QNE4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC43,11■■■■■ 4,49
Ccdc180J3QNE4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC43,11■■■■■ 4,49
Ccdc180J3QNE4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
Ccdc180J3QNE4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC43,1■■■■■ 4,49
Ccdc180J3QNE4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC43,09■■■■■ 4,49
Ccdc180J3QNE4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,49
Ccdc180J3QNE4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC43,07■■■■■ 4,49
Ccdc180J3QNE4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC43,06■■■■■ 4,48
Ccdc180J3QNE4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC43,04■■■■■ 4,48
Ccdc180J3QNE4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC43,04■■■■■ 4,48
Ccdc180J3QNE4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43,03■■■■■ 4,48
Ccdc180J3QNE4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC43,03■■■■■ 4,48
Ccdc180J3QNE4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,03■■■■■ 4,48
Ccdc180J3QNE4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,03■■■■■ 4,48
Ccdc180J3QNE4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC43,02■■■■■ 4,48
Ccdc180J3QNE4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Ccdc180J3QNE4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Ccdc180J3QNE4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Ccdc180J3QNE4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4,47
Ccdc180J3QNE4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,98■■■■■ 4,47
Ccdc180J3QNE4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC42,98■■■■■ 4,47
Ccdc180J3QNE4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,97■■■■■ 4,47
Ccdc180J3QNE4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC42,97■■■■■ 4,47
Ccdc180J3QNE4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42,96■■■■■ 4,47
Ccdc180J3QNE4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,94■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,93■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,92■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC42,92■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,92■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC42,92■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,91■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,91■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC42,91■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,9■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,89■■■■■ 4,46
Ccdc180J3QNE4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,88■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC42,88■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,87■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC42,87■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC42,86■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC42,86■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC42,86■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC42,86■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,86■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,86■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,86■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC42,84■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,83■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,83■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,83■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,45
Ccdc180J3QNE4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC42,82■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,81■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,8■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC42,79■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,78■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,78■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,77■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,76■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC42,76■■■■■ 4,44
Ccdc180J3QNE4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC42,76■■■■■ 4,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms