Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3415J3QMS8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3415J3QMS8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3415J3QMS8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3415J3QMS8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3415J3QMS8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3415J3QMS8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3415J3QMS8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3415J3QMS8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3415J3QMS8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3415J3QMS8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3415J3QMS8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3415J3QMS8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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