Protein–RNA interactions for Protein: I6XKQ3

Spdye4c, Speedy/RINGO cell cycle regulator family, member E4C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4cI6XKQ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spdye4cI6XKQ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spdye4cI6XKQ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdye4cI6XKQ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Spdye4cI6XKQ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms