Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp408H7BX78 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Zfp408H7BX78 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp408H7BX78 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp408H7BX78 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp408H7BX78 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms