Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sclt1G5E861 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sclt1G5E861 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sclt1G5E861 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sclt1G5E861 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms