Protein–RNA interactions for Protein: G3X9J0

Sipa1l3, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1l3G3X9J0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sipa1l3G3X9J0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sipa1l3G3X9J0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sipa1l3G3X9J0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sipa1l3G3X9J0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sipa1l3G3X9J0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sipa1l3G3X9J0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sipa1l3G3X9J0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sipa1l3G3X9J0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sipa1l3G3X9J0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms