Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm8909G3UXE9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm8909G3UXE9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm8909G3UXE9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm8909G3UXE9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm8909G3UXE9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm8909G3UXE9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm8909G3UXE9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm8909G3UXE9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm8909G3UXE9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms