Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn1r39G3UWE6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r39G3UWE6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r39G3UWE6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r39G3UWE6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r39G3UWE6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms