Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC43,58■■■■■ 4,57
BicraF8VPZ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC43,58■■■■■ 4,57
BicraF8VPZ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC43,58■■■■■ 4,57
BicraF8VPZ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,58■■■■■ 4,57
BicraF8VPZ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC43,58■■■■■ 4,57
BicraF8VPZ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC43,57■■■■■ 4,57
BicraF8VPZ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,55■■■■■ 4,56
BicraF8VPZ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,55■■■■■ 4,56
BicraF8VPZ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,54■■■■■ 4,56
BicraF8VPZ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43,53■■■■■ 4,56
BicraF8VPZ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC43,53■■■■■ 4,56
BicraF8VPZ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC43,53■■■■■ 4,56
BicraF8VPZ9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC43,52■■■■■ 4,56
BicraF8VPZ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC43,52■■■■■ 4,56
BicraF8VPZ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,51■■■■■ 4,56
BicraF8VPZ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,51■■■■■ 4,56
BicraF8VPZ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,51■■■■■ 4,56
BicraF8VPZ9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC43,5■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC43,5■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC43,5■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,5■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC43,49■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,49■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,48■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,48■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,47■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,45■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,45■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC43,45■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,44■■■■■ 4,55
BicraF8VPZ9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC43,44■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC43,44■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43,43■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43,43■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,41■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC43,41■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC43,41■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC43,41■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,4■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,4■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,39■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,38■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,38■■■■■ 4,54
BicraF8VPZ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,37■■■■■ 4,53
BicraF8VPZ9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,36■■■■■ 4,53
BicraF8VPZ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC43,36■■■■■ 4,53
BicraF8VPZ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC43,35■■■■■ 4,53
BicraF8VPZ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC43,34■■■■■ 4,53
BicraF8VPZ9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC43,34■■■■■ 4,53
BicraF8VPZ9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC43,33■■■■■ 4,53
BicraF8VPZ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC43,33■■■■■ 4,53
BicraF8VPZ9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43,33■■■■■ 4,53
BicraF8VPZ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,33■■■■■ 4,53
BicraF8VPZ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,31■■■■■ 4,52
BicraF8VPZ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC43,3■■■■■ 4,52
BicraF8VPZ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC43,28■■■■■ 4,52
BicraF8VPZ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43,28■■■■■ 4,52
BicraF8VPZ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,27■■■■■ 4,52
BicraF8VPZ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
BicraF8VPZ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC43,27■■■■■ 4,52
BicraF8VPZ9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC43,27■■■■■ 4,52
BicraF8VPZ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,26■■■■■ 4,52
BicraF8VPZ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC43,25■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC43,24■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,24■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,23■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC43,23■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,23■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC43,22■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,22■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,22■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC43,21■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43,21■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,21■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43,2■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43,2■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC43,2■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC43,2■■■■■ 4,51
BicraF8VPZ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC43,19■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,18■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC43,17■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,16■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC43,16■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC43,16■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,15■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC43,15■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC43,15■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,14■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC43,13■■■■■ 4,5
BicraF8VPZ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,13■■■■■ 4,49
BicraF8VPZ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
BicraF8VPZ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,1■■■■■ 4,49
BicraF8VPZ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,09■■■■■ 4,49
BicraF8VPZ9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,07■■■■■ 4,49
BicraF8VPZ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,48
BicraF8VPZ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,48
BicraF8VPZ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC43,06■■■■■ 4,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,4 ms