Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdh11xF6ZNL5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcdh11xF6ZNL5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdh11xF6ZNL5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdh11xF6ZNL5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdh11xF6ZNL5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms