Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
3110082J24RikF6Z6Z2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
3110082J24RikF6Z6Z2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
3110082J24RikF6Z6Z2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms