Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10378F6XQQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10378F6XQQ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm10378F6XQQ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10378F6XQQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10378F6XQQ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10378F6XQQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10378F6XQQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10378F6XQQ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm10378F6XQQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Gm10378F6XQQ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm10378F6XQQ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm10378F6XQQ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm10378F6XQQ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm10378F6XQQ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms