Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21974F6W3F3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21974F6W3F3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21974F6W3F3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21974F6W3F3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms