Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atf6F6VAN0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atf6F6VAN0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf6F6VAN0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf6F6VAN0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf6F6VAN0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf6F6VAN0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf6F6VAN0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms