Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sptbn5F6UCX4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sptbn5F6UCX4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sptbn5F6UCX4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sptbn5F6UCX4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sptbn5F6UCX4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.4 ms