Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21977F6U3N7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21977F6U3N7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm21977F6U3N7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm21977F6U3N7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms