Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r35E9Q7U8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vmn2r35E9Q7U8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn2r35E9Q7U8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r35E9Q7U8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms