Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6I0

Vmn2r116, Vomeronasal type-2 receptor 116, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r116E9Q6I0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r116E9Q6I0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn2r116E9Q6I0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r116E9Q6I0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r116E9Q6I0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms